由于国内航站楼正在进行翻修，因此办理检票和登机手续将通过国际航站楼的一个改造区域进行。另外，现场已经设置了指示牌，乘客在完成检票和行李托运流程后，可根据指示牌登上开往卡诺阿斯空军基地的巴士，该基地距离小萨尔加多国际机场约10公里距离，目前因为小萨尔加多的机场跑道因洪水被淹，因此暂时无法起降飞机，航班的起降仍然在卡诺阿斯空军基地的跑道上进行，因此乘客所乘坐的前往小萨尔加多机场的航班仍然会在该军事基地跑道上降落，然后由巴士摆渡至小萨尔加多机场。

另外，关于登机前的安检流程，乘客将使用位于小萨尔加多机场航站楼3层的国际航班登机区域完成登机前的安检。据悉，小萨尔加多航站楼的开放时间暂定为早上6点至晚上9点。乘客需在所乘坐的航班起飞前三小时到达机场办理。办理登机手续及行李托运流程将在航班起飞前1.5小时结束。此前，办理登机手续及行李托运流程被暂时安排在位于卡诺阿斯空军基地附近的一座商城中进行。